Обнаружил очень простой способ выполнения MySQL запросов в Debian. Причём без указания логина и пароля. В Debian’е создаётся системный пользователь debian-sys-maint, от которого и будут идти запросы. Например выборка:
echo "SELECT * FROM database.table WHERE id > 10" | mysql --defaults-file=/etc/mysql/debian.cnf -Bs
Можно мониторить нагрузку:
watch 'echo "show full processlist" | mysql --defaults-file=/etc/mysql/debian.cnf -Bs'